通往自由之路
“通往自由任务”是主线必做任务，请见主线任务第二幕。
交易手段
想与铁路兄弟会有更多来往的话，可以在铁路HQ与铁路兄弟会的迪耿交谈。如果你要找铁路帮你建造主线剧情需要的传送装置，则必须进行这个任务。
和迪耿交谈后，分头离开铁路HQ。铁路HQ有个逃生通道，从这出去，下次可以从这里进铁路HQ，反正日后都可以直接快速旅行。
接着沿西北方向走一段比较长的路来到指定地点，和迪耿会和。
在你前往铁路兄弟会的老基地前，迪耿想从附近的铁路巡回员身上得到一些情报。爬上废弃高速公路，清理掉敌人，与瑞奇·道尔顿见面。可以跟他说铁路的密码，不说的话迪耿会来搞定。
不妙的是，铁路老基地被稍旧型号的合成人占领了，你可以选择两条路线进入总控间：
听从迪耿的建议从下水道进入，从这里走战斗、地雷较少，推荐。
尝试列克星敦郊外的正门进入，这里有很多陷阱和敌人。之后也要进入下水道。
下水道入口
路上有控制门的终端机和最后拿原型的门迪耿会帮你打开，还有一个新手级的终端机自己可以开。拿到原型机后，迪耿会给你尸体上的解放者手枪作为奖励。
之后可以直接从电梯离开。
总控间地图
与迪耿一同离开后，可以选择返回铁路HQ。戴瑟蒙娜会接纳你进入组织，并让你选择自己的代号，之后铁路就会用这个代号称呼你。
之后可以和同伴迪耿同行。
地下卧底
如果在完成主线任务“分子等级“时，你是和铁路组织合作的，那么你会得到戴瑟蒙娜给你的网络扫描器全像卡带。
在学院内，找到任何一台终端机，侵入后，插进网络扫描器全像卡带，选择复制加密讯息，会收到来自爱国者的回复。按返回，选择”阅读紧急回复“，即可和爱国者见面。
爱国者即黎安·贝奈，在学院先进系统的维修室里。见面后跟他去见合成人Z1-14。
再次和黎安对话后，回到戴瑟蒙娜处报告。
和戴瑟蒙娜对话后，去铁路HQ的小帕姆主机终端机上，选择输入学院报告。之后和旁边的机器人小帕姆对话。之后前往剑桥聚合物研究所。
剑桥聚合物研究所里机器人茉莉会迎接你。
如果你顺着它的话说，跟着它走，最后会被锁在脱毒室。有密码的终端机在C3实验室，进入有两种方法：
骇入控制们的终端机（专家级）。
从旁边的通向天花板的斜坡爬上去，一路绕到底，再跳下去。
就是这个斜坡
拿到密码后就需要出去，可以在C3实验室的终端机进入设施防卫系统进行紧急复写，茉莉会来杀你，一路杀出去后就可以打开脱毒室大门出去了。
你也可以选择在这收集材料完成专案工作再出去。
以上全部过程更快的方法是，刚进研究所，不要和茉莉吹比，立刻把茉莉干掉。你会拿到一把钥匙。之后用钥匙直接进入楼上的房间，用这里的终端机解开安全锁即可进入脱毒室。之后重复同样步骤拿到密码。
回到铁路HQ和戴瑟蒙娜对话。之后回到学院，和爱国者黎安对话，把密码给他。再和合成人Z1-14对话，他要一天时间准备。
在椅子上等待一天（或者用别的方式打发一天）后，再和Z1-14对话，准备开始行动。这里有一个可选任务，你可以把任意武器放到地图表明的箱子里，帮助合成人。不放也没有关系，直接通过电梯下楼，杀死所有守卫。
回到Z1-14处，他会让你继续和父亲大人合作。
之后你需要继续完成学院任务”人类——重新定义“和”大核融合厂“。
完成这两个任务后，Z1-14会找你见面。他会告诉你钢铁兄弟会要来搞铁路了，回铁路HQ报信，之后开始任务“战事一触即发”。
战事一触即发
警告戴瑟蒙娜之后，需要防卫铁路基地。首先清除基地内的敌人，之后进入通往老北教堂的隧道，在隧道内核葛洛莉对话后，清除其他敌人。上到教堂，清除所有敌人后，和戴瑟蒙娜对话。
前往剑桥警察局和工匠汤姆会和。和汤姆对话后去血洗剑桥警察局。一路杀到顶楼。杀光敌人后，和工匠汤姆对话，他会给你炸药，之后汤姆进入飞机驾驶舱。警察局里有《枪与子弹》杂志，见下面地图位置。
剑桥警察局地图
这段时间你要保护垂直升降机，摧毁空中来袭的敌人。杀光最后一波敌人后，和迪耿对话，拿到瓶盖和武器，完成任务“战事一触即发”。
火箭的红色火光
上到直升机里，控制迷你机枪。直升机顺利被收纳进普利德温号后，换上汤姆给你的兄弟会制服，进去装炸弹。
接近安装地点后，有比较大的几率被发现。被发现后立刻装完炸弹往回跑。中途会遭遇强大的火力，适当用子弹清除路来，因为有些敌人挡着你可能过不去。
使用潜行可以降低被发现的几率，普利德温号里有很多珍稀服装道具，可以参考下面地图搜刮一下。
回到直升机后，飞艇被炸。之后回到铁路HQ，完成任务。
核能选项（铁路）
本任务即铁路路线的结局。
在铁路HQ和戴瑟蒙娜对话。
回到学院，坐电梯上楼。和Z1-14对话，杀死中继站控制室的所有其他人。清空后戴瑟蒙娜等人会传送过来。
和戴瑟蒙娜对话，动身前往反应炉。一路沿途把敌人清理干净后，汤姆会说打不开反应炉的门。来到父亲大人所在地旁边的终端机处，解开安全锁定。这时候你也可以决定父亲大人的生死。
来到大厅，又是一场激战。不一定要全部消灭敌人，一路重进反应炉，和反应炉互动。几秒种后就会自动被传送到外面。这里可以选择是否带走合成人孩子。和合成人孩子对话后，和汤姆对话，进入中继站。
最后按下核爆按钮，游戏会播放结局动画。
